El proceso se inicia con bacterias anaerobias, dando lugar a fermentaciones, que hace aumentar la temperatura, llegando incluso a los 70ºC. Más tarde, cuando el oxígeno está cada vez más presente, baja la temperatura, la anaerobiosis se ralentiza e incluso se detiene, desapareciendo los organismos anaerobios, termófilos, sustituidos por los aerobios, mesófilos. Los actinomicetos y los hongos aerobios terminan de preparar el sustrato, terminándose el proceso de composteo por microorganismos.